Biologia Celular Hemacias Hematologia IA Microscopia OPENCV
Marcelo Martins , , ,
Projeto contagem de Hemácias

Este trabalho, esta sendo baseado, no treinamento realizado por mim, e adaptado, através do curso que estou fazendo:

https://www.udemy.com/course/deteccao-de-objetos-com-python-e-opencv/

Segue explicação em vídeo:

Este projeto é uma continuação do trabalho colocado no github:

https://github.com/marcelomaurin/hemacias

No programa teste03.py, apresento como capturar a imagem e fiz alguns tratamentos de fundo, usando opencv.

Neste artigo, irei preparar imagens para gerar o reconhecimento da hemácia.

Para tanto fiz a captura da hemácia, através da microscopia. Utilizando um microscópio com lente de ampliação de 20x, com uma câmera USB de 2Mb pixels.

Pegando a figura abaixo:

Irei tratar a imagem abaixo, para tentar reconhecer e contar as hemácias.

Para tanto o primeiro trabalho, é trabalhar com a imagem, fazendo duas etapas:

Retirar fundo da imagem da hemácia, e incluí-la em um banco de imagens de fundo.

Neste artigo, irei tratar cada uma destas atividades.

Retirar o Fundo da Imagem

Agora que tenho a imagem, usarei o site

https://www.remove.bg/

Para retirar o fundo da imagem. O procedimento é bem simples, faz-se o upload da imagem já recortada, para o site, e lá retira-se o fundo, com o auxilio de ferramentas do próprio site.

O site é bem intuitivo e pode ser usado livremente.

Ao final criamos a imagem sem o fundo, que iremos utilizar.

Criando imagem Positiva

A imagem positiva é a imagem que deve possuir a hemácia.

Neste primeiro momento eu preciso de uma base de imagens.

Para isso preciso baixar um grande volume de imagens para gerar tanto imagens positivas como negativas.

Eu peguei as imagem recortada, com os fundos apresentados no aplicativo, e fui recortando montando um banco de imagens coloridos.

Imagens de Teste

Para as imagens de teste, eu peguei imagens de internet e recortei.

Conforme apresentado a baixo:

Para ter sucesso, precisarei refazer esse teste, com pelo menos uma dúzia de hemácias, produzindo pelo menos 1000 imagens.

Este trabalho é longo e demorará vários dias.

Trabalhando com as imagens

No próximo artigo iremos processar a imagens de treino, criando uma base real de treinamento.

Biologia Celular microbiologia Microscopia Python
Marcelo Martins ,
Microscopia – Humana

Ovary

Ovário

Ovário é o órgão onde são produzidos os gametas femininos (células sexuais) tanto nos animais como nas plantas (os seres vivos com órgãos diferenciados), formado por uma região medular rica em vasos e a cortical, onde se localizam os folículos. Eles têm a forma de amêndoa, medindo até 5 cm em seu maior diâmetro e possui uma espessura máxima de 1,5 centímetros.

Sua região medular contém numerosos vasos sanguíneos e regular quantidade de tecido conjuntivo frouxo, e a cortical, onde predominam os folículos ovarianos, contendo os ovócitos. O ovário começa a se desenvolver ainda na barriga da mãe.

Fonte: https://pt.wikipedia.org/wiki/Ov%C3%A1rio

Microscopia

Ampliação 5x

Ampliação 10x

Ampliação 40x

Biologia Celular microbiologia Microscopia
Marcelo Martins ,
Microscopia humana

Pancreas

Pâncreaas

O pâncreas é uma glândula de aproximadamente 15 cm de extensão fazendo parte do sistema digestivo e endócrino dos seres humanos que se localiza atrás do estômago e entre o duodeno e o baço. Ele é tanto exócrino (secretando suco pancreático, que contém enzimas digestivas) quanto endócrino (produzindo muitos hormônios importantes, como insulina, glucagon, somatostatina e amilina). Divide-se em cabeça, corpo e cauda. O pâncreas é um órgão produtor de enzimas, proteínas que aumentam a rapidez das transformações químicas.

Fonte: https://pt.wikipedia.org/wiki/P%C3%A2ncreas

Microscopia

Ampliação 40x

Ampliação 10x

Ampliação 5x

Biologia Celular microbiologia Microscopia
Marcelo Martins ,
Microscopia – Fotos

Stem of cotton X.S.

Caule de algodão X.S.

O algodoeiro é o nome vulgar dado a várias espécies do género botânico Gossypium L., da família Malvaceae. Existem cerca de 40 espécies, arbustivas, nativas das regiões subtropicais e tropicais, algumas das quais são utilizadas para a produção da fibra têxtil conhecida como algodão.

Em estado selvagem, os arbustos do algodoeiro conseguem atingir até 7 m de altura. As folhas são grandes, com três, cinco (ou mesmo sete) lobos. As sementes estão contidas numa cápsula, estando cada uma envolvida numa fibra felpuda designada pelo vocábulo inglês lint (plural: linters). As espécies mais utilizadas para fins comerciais são G. hirsutum (Estados Unidos e Austrália), G. arboreum e G. herbaceum (Ásia), e G. barbadense (Egipto). Os linters são, geralmente brancos, mas existem também variedades com cor castanha ou verde que, para não contaminarem geneticamente a variedade branca, têm a sua plantação banida junto às grandes produções de algodão.

Fonte: https://pt.wikipedia.org/wiki/Algodoeiro

Microscopia

Ampliação 40x

Ampliação 10x

Ampliação 5x

Microscopia
Marcelo Martins
Fotos de Microscopia

Apresentação de algumas imagens de microscopia

stem of wood dicotyledon x.s.

caule de madeira dicotiledônea x.s.

As dicotiledôneas , também conhecidas como dicotiledôneas (ou, mais raramente, dicotiledôneas ), [2] são um dos dois grupos em que todas as plantas com flores (angiospermas) foram anteriormente divididas. O nome refere-se a uma das características típicas do grupo: a saber, que a semente possui duas folhas embrionárias ou cotilédones . Existem cerca de 200.000  espécies dentro deste grupo. [3] O outro grupo de plantas com flores foi chamado de monocotiledôneas (ou monocotiledôneas), geralmente cada uma com um cotilédone. Historicamente, esses dois grupos formaram as duas divisões das plantas com flores.

Principalmente a partir da década de 1990, a pesquisa filogenética molecular confirmou o que já se suspeitava: que as dicotiledôneas não são um grupo formado por todos os descendentes de um ancestral comum (ou seja, não são um grupo monofilético ). Em vez disso, várias linhagens, como as magnoliidas e grupos agora conhecidos coletivamente como angiospermas basais , divergiram antes das monocotiledôneas; em outras palavras, as monocotiledôneas evoluíram de dentro das dicotiledôneas, conforme definido tradicionalmente. Os dicotiledôneas tradicionais são, portanto, um grupo parafilético . [4]

As eudicotiledôneas são o maior grupo monofilético dentro das dicotiledôneas. Eles se distinguem de todas as outras plantas com flores pela estrutura de seu pólen . Outras dicotiledôneas e as monocotiledôneas possuem pólen monossulcado (ou formas derivadas): grãos com um único sulco. Em contraste, eudicotiledôneas têm pólen tricolpado (ou formas derivadas): grãos com três ou mais poros dispostos em sulcos chamados colpos.

Imagens de Microscópio

Ampliação 40x

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